| 路線ID | 路線名 | 事業者名 | 駅区間 | 駅数 | 経由都道府県 |
|---|---|---|---|---|---|
| 6 |
湯前線
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くま川鉄道 | 東多良木 〜 人吉温泉 | 14 | 熊本県 |
| 109 |
九州新幹線
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九州旅客鉄道 | 新八代 〜 博多 | 6 | 福岡県・熊本県・鹿児島県 |
| 113 |
三角線
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九州旅客鉄道 | 緑川 〜 宇土 | 2 | 熊本県 |
| 116 |
鹿児島線
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九州旅客鉄道 | 枝光 〜 富合 | 72 | 福岡県・佐賀県・熊本県・鹿児島県 |
| 126 |
肥薩線
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九州旅客鉄道 | 植村 〜 日当山 | 25 | 熊本県・宮崎県・鹿児島県 |
| 127 |
豊肥線
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九州旅客鉄道 | 敷戸 〜 光の森 | 31 | 熊本県・大分県 |
| 128 |
幹線
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熊本市 | 河原町 〜 祇園橋 | 10 | 熊本県 |
| 129 |
健軍線
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熊本市 | 健軍交番前 〜 水前寺公園 | 9 | 熊本県 |
| 130 |
上熊本線
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熊本市 | 県立体育館前 〜 洗馬橋 | 8 | 熊本県 |
| 131 |
水前寺線
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熊本市 | 水前寺公園 〜 水道町 | 7 | 熊本県 |
| 132 |
田崎線
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熊本市 | 二本木口 〜 熊本駅前 | 3 | 熊本県 |
| 133 |
菊池線
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熊本電気鉄道 | 上熊本 〜 池田 | 16 | 熊本県 |
| 134 |
藤崎線
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熊本電気鉄道 | 藤崎宮前 〜 北熊本 | 3 | 熊本県 |
| 469 |
高森線
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南阿蘇鉄道 | 立野 〜 南阿蘇白川水源 | 9 | 熊本県 |
| 488 |
肥薩おれんじ鉄道線
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肥薩おれんじ鉄道 | 出水 〜 川内 | 25 | 熊本県・鹿児島県 |
